Die Peninsular-Kampagne ist eine Story-Erweiterung für Napoleon: Total War, die eine völlig neue und unabhängige Kampagne einführt, die im Iberischen Halbinselkrieg von 1811–1814 spielt. In diesem Konflikt entstand der Begriff "Guerilla", der die verheerenden Guerillataktiken der spanischen Aufständischen gegen Napoleons Armee beschreibt. Die Kampagne führt den Spieler mitten in eines der komplexesten Kriegsschauplätze der napoleonischen Ära. Nach den unklaren Ergebnissen der früheren Gefechte versuchen die Franzosen, die Kontrolle über die Region zu behalten, während britische, spanische und portugiesische Truppen eine entscheidende Gegenoffensive vorbereiten. Die Unterstützung der lokalen Bevölkerung, Guerillaaktivitäten und der Kampf um politischen Einfluss in einzelnen Provinzen spielen eine Schlüsselrolle.