The Legend of Heroes: Trails into Reverie to kulminacja wieloletniej sagi Zemurii, w której losy trzech kluczowych bohaterów splatają się w jednym, przełomowym rozdziale. Rean Schwarzer, Lloyd Bannings oraz tajemniczy „C” prowadzą własne, niezależne ścieżki fabularne, a dzięki systemowi Trails to Walk możesz swobodnie przełączać się między nimi, odkrywając kolejne elementy skomplikowanej, wielowątkowej historii. Lloyd ponownie staje do walki o wolność Crossbell, kiedy miasto pada ofiarą starego zagrożenia. Rean, po wydarzeniach Great Twilight, próbuje wrócić do normalności wraz ze swoimi uczniami, lecz spokój szybko przeradza się w nowe niebezpieczeństwo. Tymczasem tajemnicza grupa, prowadzona przez zamaskowanego „C”, bada powrót byłego gubernatora Crossbell, którego działania mogą zagrozić całej Zemurii.