Pod dowództwem kapitana Christophera Pike'a sprawdzona załoga U.S.S. Enterprise staje twarzą w twarz ze skutkami niszczycielskiej inwazji Gornów z drugiego sezonu. Ponadto załoga przeżyje niezliczone przygody pełne emocji i niespodzianek, odkrywając mroczne sekrety, stawiając czoła potężnym zagrożeniom i znajdując się w nieprzewidzianych sytuacjach. Dzięki wprowadzeniu późniejszej legendarnej roli kapitana Jamesa T. Kirka oraz innym bardzo ekscytującym odcinkom, ten sezon przenosi uniwersum Star Treka na zupełnie nowe wymiary.